Karen 슬롯 무료체험

슬롯 무료체험 교수

요약

전기

DR. 슬롯 무료체험는 의미있는 생물학적 가설을 찾기 위해 크고 복잡한 전체 생성 실험을 분석하기 위해 새로운 수학 및 통계 기술을 개발하는 것을 즐기는 수학자입니다. 현재 Dr. 슬롯 무료체험는 Desert Research Institute 및 Renown Hospital에 보관 된 Healthy Nevada 프로젝트의 주요 통계 유전 학자입니다.

DR. 슬롯 무료체험는 많은 의사들과 협력하여 흥미로운 질병에서 유전자형과 질병의 가능한 연관성을 예측합니다 : 만성 노동, 만성 피로 증후군, 걸프-전쟁 증후군, 알츠하이머 병 및 비만..

그녀는 슬롯 무료체험적으로 의미 있고 통계적으로 엄격한 결과를 생성하기 위해 강력한 실험 설계, 적절한 통계적 방법 및 강력한 수학적 도구를 사용하는 것을 강력하게 옹호합니다.

슬롯 무료체험 관심사

  • 개인화 의학
  • 게놈 전체 협회 슬롯 무료체험
  • Biostatistics
  • Bioinformatics

우리의 실험실은 다양한 플랫폼에서 생성 된 대규모 전체 게놈 데이터 세트를 슬롯 무료체험하기위한 새롭고 강력한 수학적 도구를 개발하는 데 중점을 둡니다.

자신감을 가진 슬롯 무료체험

표현 데이터에 상당한 양의 임의의 변동이 포함되어 있고 클러스터가 적용된 절차에 의존함에 따라 클러스터에 대한 신뢰 측정의 할당이 유용합니다. 구체적으로, 우리는 클러스터링 루틴에 의해 얻은 유전자 그룹에 신뢰 측정을 할당하는 통계 슬롯 무료체험래밍 언어 R에서 알고리즘을 구현했습니다. 의사-랜덤 유전자 발현 데이터 세트를 시뮬레이션하기 위해 순열 테스트 및 볼록한 선체 방법을 사용하여 무작위로 생성 된 세트에서 통계를 얻기 위해 원래 데이터와 비교할 수있는 기초를 제공합니다.

표현 슬롯 무료체험를 모델링하는 그래프 이론 도구

빅 데이터 분석은 연구원에게 중요한 도전입니다. 여러 상태 나 조건에서 독립적이지는 않지만 수천 개의 데이터 포인트의 병렬 분석은 통계 분석 및 모델 구성을위한 흥미로운 플랫폼을 제공합니다. 표준 계층 적 클러스터링 기술을 이러한 데이터에 적용 할 수 있지만 이러한 패턴을 식별하는 표준 도구는 존재하지 않습니다. 우리는 알려지지 않은 유전자의 기능에 대한 가설을 제안하는 추정 기능 네트워크 모델을 구성하기위한 그래프 이론적 접근법을 개발했습니다. 이 기술은 유망한 결과를 가진 여러 현재 실험에 적용되었습니다. 혁신적인 거리 메트릭은 일반적으로 사용되는 거리 지표보다 슬롯 무료체험적으로 근거한 방식으로 모든 유전자 쌍 간의 유사성을 측정하기 위해 개발 중입니다. 이러한 유사성 관계를 사용하여, 양방향 그래프는 유사성 정도에 기초한 유전자를 연결함으로써 생성된다. 이 그래프에서 그래프 연결 구조 내에서 "클러스터"를 감지 할 수 있습니다. 이들 클러스터는 유전자 기능 및 상호 작용의 가설을 제공하고, 연구중인 유기체의 스트레스 반응 및 적응 메커니즘과 관련된 생화학 적 경로 변화와 유전자의 연관을 안내한다. 진행중인 연구는 또한 분석 후 결과와 클러스터의 슬롯 무료체험적 의미, 종종 표현 데이터 분석의 단계 인 단계에 중점을 둡니다. 우리는 또한 이러한 방법을 일반적인 공동 발현 네트워크 도구와 비교하고 있습니다.

조합 방법과 슬롯 무료체험 상호 작용 모델링

복잡한 네트워크는 종종 유전자 시스템뿐만 아니라 계층 적 사회, 슬롯 무료체험적 또는 통신 시스템을 모델링하는 데 사용됩니다. 첫 번째 근사치로서 부울 네트워크가 종종 사용됩니다. Reinhard Laubenbacher 교수와 함께 Virginia Bioinformatics Institute에서 연구의 일환으로, 우리는 부울 네트워크를 단순한 단지의 모음으로 인코딩하는 방법을 개발했습니다. 우리는 또한 이러한 단순한 복합체를 분석하기 위해 토폴로지 공간의 동종 토피 이론의 조합 유사체를 확립했다. 결과적인 조합 불변은 네트워크의 역학에 대한 정보를 제공합니다. (부울) 네트워크 구조를 통해 유전자 관계를 표현함으로써, 조합 동종 토피 이론의 응용은 유전자 하위 군 내외에서 전반적인 네트워크 행동과 영향 패턴을 보여줄 수있다..

마이크로 어레이 슬롯 무료체험 발현 데이터의 시각화

각 채널 및 배경 수정 비율 값에 대해 2- 색 CDNA 마이크로 어레이의 강도 수준의 인공 히트 맵이 생성됩니다. 이 이미지를 사용하면 사용자가 배열에 공간 변동이 나타나는지 또는 제어 지점이 예측대로 작동하는지 여부를 신속하게 결정할 수 있습니다. 마찬가지로,이 도구는 Affymetrix 및 Nimblegen ™에서 만든 것과 같은 고밀도 올리고 뉴클레오티드 어레이에 적용 할 수 있습니다. 이 기술은 연구원에게 실험에서 각 배열에 대한 새의 시선을 제공합니다. 이 소프트웨어는 R 슬롯 무료체험래밍 언어로 작성되었으며 사용 및 구현하기가 매우 간단합니다.

SNP 데이터를 슬롯 무료체험한 일배 체형 공유 및 미세 매핑의 시각화

고 처리량 유전자형 분석 실험에서 비롯된 데이터 분석을 위해, 우리는 미세 매핑 유전자 연관성을위한 SNP의 선택을 자동화하는 도구를 개발했습니다. 이 도구는 주어진 관심 대립 유전자에 대한 장거리 연결 불균형 패턴을 표시하기 위해 계층 적 클러스터링 접근법을 통해 일배 체형으로 그룹화되는 단계적 염색체로부터 유전자형의 그래프를 생성한다. 우리는 현재 HAPMAP 슬롯 무료체험젝트의 단계적 염색체 데이터를 사용하고 있으며, 무엇보다도 Affymetrix 100K SNP Genechip에 포함 된 SNP를 강조합니다. 이 그래프는 관련 SNP가 발생하는 일배 체형을 식별하고 주어진 연관에 대한 원인 변형을 포함 할 수있는 영역을 식별 할 수있게한다.

HAPMAPPER 내의 별도 모듈은 일배 체형을 구별하는 데 도움이되는 SNP와 관련 대립 슬롯 무료체험와의 강한 연계 불균형 및 해당 영역의 다른 SNP에 대한 프록시 인 SNP를 식별합니다. 이 데이터는 시각적 디스플레이에 통합되어 관련 대립 슬롯 무료체험를 포함하는 미세 매핑 하플로 타입을위한 SNP 선택을 지원합니다. 이 소프트웨어는 R로 작성되었으며 여러 관심 영역을 미세 매핑하는 데 사용하기 위해 구현되었습니다.

코스 가르침

  • BCH 709 슬롯 무료체험 정보 소개

최근 간행물

전체 참고 문헌

  • 슬롯 무료체험 KA, Kulick D, Subramanian K, De Meirleir KL, Palotás A, Lombardi VC. 심장 대사 질환이없는 상당히 비만 여성의 코호트에서 단일-뉴클레오티드 다형성. int J obes (Lond). 2019 년 8 월 17 일. DOI : 10.1038/S41366-018-0181-3. [인쇄에 앞서 EPUB] PMID : 30120429
  • De Meirleir KL, Mijatovic T, Subramanian K, 슬롯 무료체험 KA, Lombardi VC. 근심성 뇌종염의 진단을위한 4 가지 임상 실험실 매개 변수의 평가. J 번역 메드. 2018 년 11 월 21 일; 16 (1) : 322. doi : 10.1186/s12967-018-1696-Z. PMID : 30463572
  • Romanick SS, Ulrich C, 슬롯 무료체험 K, Hostler A, Payne J, Woolsey R, Quilici D, Feng Y, Ferguson BS. 심장 단백질 아세틸 화의 비만-매개 조절 : TMT- 태그 된 질량 분석법을 통한 총 및 아세틸 화 된 단백질의 병렬 분석. Biosci Rep. 2018 년 9 월 7 일; 38 (5). doi : 0.1042/bsr20180721. PMID : 30061171
  • O'Brien KM, Rix AS, Egginton S, Farrell AP, Crockett EL, 슬롯 무료체험 K, Woolsey R, Hoffman M, Merriman S.J. 심장 미토콘드리아 대사는 적혈구 및 백혈구 남극 비토 테니 오이드 어류의 열 내성의 차이에 기여할 수 있습니다. Exp Biol. 2018 년 8 월 13 일; 221 (Pt 15). doi : 10.1242/jeb.177816.
  • Rahmati Ishka M, Brown E, Weigand C, Tillett RL, 슬롯 무료체험 KA, Miller G, Harper JF. 야생형 아라비돕시스 꽃가루와 열 감광성 돌연변이 체 사이의 열-스트레스 전 사체 변화의 비교는 순환 뉴클레오티드-게이트 양이온 채널 16 (CNGC16)의 녹아웃을 보유한 열-민감성 돌연변이 체 사이의 비교. BMC 유전체학. 2018 년 7 월 24 일; 19 (1) : 549. doi : 10.1186/s12864-018-4930-4. PMID : 30041596
  • Copley Salem C, Ulrich C, Quilici D, 슬롯 무료체험 K, Buxton Ilo, Burkin H. 기계적 균주는 자궁 평활근 세포에서 인-단백질 학적 신호 전달을 유도합니다. J Biomech. 2018 년 5 월 17 일; 73 : 99-107. doi : 10.1016/j.jbiomech.2018.03.040. Epub 2018 3 월 30 일. PMID : 29661501
  • Singh S, Stafford P, 슬롯 무료체험 KA, Tillett RR, Gollery M, Johnston SA, Khaiboullina SF, De Meirleir KL, Rawat S, Mijatovic T, Subramanian K, Palotás A, Lombardi VC. 임의의 펩티드 마이크로 어레이를 사용하여 근육 성 뇌종 근육통이있는 대상체의 체액 면역 프로파일 링은 특이성과 민감도가 높은 대조군과 사례를 구분한다. Mol Neurobiol. 2018 년 1 월; 55 (1) : 633-641. doi : 10.1007/s12035-016-0334-0. Epub 2016 12 월 15 일. PMID : 27981498
  • Nadeau, JA, Petereit J, Tillett RJ, Jung M, Fotoohi M, MacLean M, Young S, 슬롯 무료체험 K, Blomquist GJ, Tittiger C. Mountain Pine Beetle Beetle Pheromone-Biosynthetic 조직의 비교 전사학 및 CYP6DE3의 기능 분석. BMC Genomics 2017 4 월 20 일; 18 (1) : 311
  • Anokhin VV, Bakhteeva LB, Khasanova GR, Khaiboullina SF, Martynova EV, Tillett RL, 슬롯 무료체험 KA, Lombardi VC, Rizvanov AA. HIV/AIDS 사례에서 이전에 미확인 단일 뉴클레오티드 다형성은 임상 파라미터 및 질병 진행과 관련이있다. 바이오로드 res int. 2016; 2016 : 274248. PMID : 28050553.
  • Singh S, Stafford P, 슬롯 무료체험 KA, Tillett RR, Gollery M, Johnston SA, Khaiboullina SF, De Meirleir KL, Rawat S, Mijatovic T, Subramanian K, Palotás A, Lombardi VC. 임의의 펩티드 마이크로 어레이를 사용하여 근육 성 뇌종 근육통이있는 대상체의 체액 면역 프로파일 링은 특이성과 민감도가 높은 대조군과 사례를 구분한다. Mol Neurobiol. 2016 년 12 월 15 일. PMID : 27981498
  • Mukhamedyarov MA, Rizvanov AA, Yakupov EZ, Zefirov AL, Kiyasov AP, Reis HJ, Teixeira AL, Vieira LB, Lima LM, Salafutdinov II, Petukhova Eo, Khaiboullina SF, Schlumaluch 슬롯 무료체험, Lombardato a A. 알츠하이머 병에 대한 잠재적 바이오 마커로서 혈액 림프구 및 피부 섬유 아세포, 각질 세포 및 내피 세포의 전사 분석. J Alzheimers dis. 2016 년 10 월 18 일; 54 (4) : 1373-1383. PMID : 27589530
  • Petereit J, Smith S, Harris FC Jr, 슬롯 무료체험 KA. 꽃잎 : R. BMC Syst Biol의 공동 발현 네트워크 모델링. 2016 년 8 월 1 일; 10 Suppl 2:51. PMID : 27490697
  • 슬롯 무료체험 KA, Khaiboullina SF, De Meirleir KL, Rawat S, Petereit J, Rizvanov AA, Blatt N, Mijatovic T, Kulick D, Palotás A, Lombardi VC. 게놈 전체 연관 분석은 근육 성 뇌종염/만성 피로 증후군이있는 대상체의 유전 적 변화를 식별합니다. Transs Psychiatry 2016 2 월 9. PMID : 26859813
  • Copley Salem C, Ulrich C, Quilici D, 슬롯 무료체험 K, Buxton Ilo, Burkin H. 기계적 균주 유도 자궁 평활근 세포에서 포스 포-단백질 신호 전달. J Biomech2018 5 월 17 일; 73 : 99-107. doi : 10.1016/j.jbiomech.2018.03.040. Epub 2018 3 월 30 일 PubMed PMID : 29661501; PubMed Central PMCID : PMC5932261.